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實驗原理 

全轉錄組,指的是特定細胞在某一狀態下所有轉錄產物的集合,包括了mRNA和非編碼RNA,例如 IncRNA , miRNA , circRNA等。隨著近些年對于非編碼RNA研究的不斷深入,發現多種非編碼RNAlncRNAI circRNA)可作為競爭內源RNA (competitive endougenous RNA, ceRNA)參與基因的表達調控, ceRNAs可以通過與mRNA競爭結合miRNA來調節基因轉錄本的翻譯。全轉錄組分析便是針對一份樣品同時分析mRNA, IncRNA, circRNAmiRNA之間的聯合調控關系,全面構建精細的RNA調控網絡, 也能有利于對于ceRNAsmiRNAmRNA調控機制進行深入挖掘,更好的闡明生物學的相關問題。

全轉錄組分析的主要目標是了解不同類型轉錄產物之間的行為和機制,其具有分析內容更加全面,可靠性更高等優點,可廣泛應用于免疫機制、疾病領域、發育進化研究、致病機理和藥物靶標等研究。


實驗路線

全轉錄組依據研究對象的不同可以分為兩種建庫方式:



技術路線


樣本要求

建兩個庫

RNA

5μglncRNA:2μgsRNA:3μg

濃度

>200ng/μl

RIN

>7.5

建三個庫

RNA

10μglncRNA:2μgsRNA:3μgcirRNA:3μg

濃度

>200ng/μl

RIN

>7.5



實驗周期

60工作日。

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